曾幾何時，世界上突然出現無數身形龐大的巨人，普通人類的生命受到前所未有的威脅。

為了保護自身安全，最后的人類筑起三座高墻：瑪莉亞、露絲和希娜。

人類迎來了長達一個世紀的和平歲月，卻也讓自己成為圈養在籠中的鳥兒，屈辱地失去自由。

845年，高達60米的超大型巨人和鎧之巨人登場， 摧毀了最外層的瑪莉亞之壁，也驚醒了人類似乎永遠不會蘇醒的長夢。

在此事件中，不愿蜷縮在墻內的少年艾倫·耶格爾親眼目睹母親遇害，由此更堅定了他加入調查兵團的決心。

在此之后，艾倫和青梅竹馬三笠·阿克曼、好友阿爾敏·亞魯雷特加入第104期訓練兵團，發誓成為足以消滅所有巨人的英勇戰士。

百年的和平結束，人類和巨人的戰爭再度拉開序幕……